L'espace muséographique, les salles de découverte, les salles d'exposition, le centre de ressource, le parc, la cantine et -bien sûr- les toilettes sont équipés pour être accessibles aux personnes en fauteuil roulant.
L'hébergement comprend 2 chambres en rez de chaussée spécialement équipées pour les handicapés.

Les animateurs du Centre EDEN organisent aussi des séjours pour handicapés mentaux, jeunes ou adultes, en liaison avec leurs éducateurs. Ces séjours -comme les classes de découverte- font alterner la découverte sur le terrain et le travail en salle.